Исследование оптических свойств бактериохлорофилла а в составе фрагмента B800 светособирающего комплекса Rhodoblastus acidophilus при помощи нестационарных расчетов на основе теории функционала плотности : научное издание

Описание

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2025

Идентификатор DOI: 10.22184/1993-7296.FRos.2025.19.4.304.311

Ключевые слова: light-harvesting complex, purple bacteria, dft, Dftb, Td-dft, optical absorption spectra, светособирающие комплексы, пурпурные бактерии, спектры оптического поглощения

Аннотация: Time-dependent density functional theory-based approaches, TD-DFT and TD-DFTB, are used to study the optical absorption of B800 part of light-harvesting complex 2 (LH2) of Rhodoblastus acidophilus. Calculated spectra for both single molecule and the optimized structure of B800 complex containing nine of such molecules are in qualitПоказать полностьюative agreement with experimental data. The absence of any sizable effects originating from the interaction between adjacent molecules are proved. Thus, optical features of B800 LH2 part are not connected to the structural organization of pigments. The importance of the time-dependent procedure for the correct description of BChl a absorption spectrum is demonstrated. При помощи нестационарных расчетов на основе теории функционала плотности методами TD-DFT и TD-DFTB исследованы оптические свойства фрагмента B800 светособирающего комплекса 2 (LH2) Rhodoblastus acidophilus. Полученные в результате расчетов спектры поглощения как одиночной молекулы BChl a, так и оптимизированной структуры B800, состоящей из 9 молекул, качественно согласуются с экспериментальными данными. Доказано отсутствие значимых эффектов, обусловленных взаимодействием между соседними молекулами. Таким образом, спектральные особенности B800 не связаны со структурной организацией молекул пигментов. Показана важность нестационарных расчетов для корректного описания спектра поглощения BChl a.

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Фотоника

Выпуск журнала: Т. 19, 4

Номера страниц: 304-311

ISSN журнала: 19937296

Место издания: Москва

Издатель: АО "Рекламно-издательский центр "Техносфера"

Персоны

Вхождение в базы данных